Más consejos para tener una configuración más adecuada de MySQL, en este caso desde el punto de vista de la arquitectura.

• Instala MySQL en su propia partición de disco duro.
• Cada servidor de MySQL debe tener us propio directorio de administración, directorio de logs, scripts, …
• Situa los ficheros de datos y los ficheros de logs binarios en discos y controladores separados si es posible, nunca tengas los ficheros de datos y los que sirven para recuperarlos en el mismo lugar físico.
• Haz copia de seguridad de tus ficheros de configuración.
• Cambia la configuración de tu base de datos poco a poco para ir como se va comportando.
• Antes de actualizar MySQL asegurate de conocer los cambios de la release y estudia que las aplicaciones sean compatibles con la nueva versión.
• Comprueba de vez en cuando la recuperación de backups
• Intenta usar programas para monitorizar y controlar tu MySQL.

The MySQL Optimal Configuration Architecture